Avant de développer ce sujet d'espoir pour l'Humanité, rappelons que l’utilisation de l’ADNe permet d'analyser le régime alimentaire d’une espèce, d'inventorier la biodiversité d’un écosystème, de reconstruire la biodiversité passée, de détecter des espèces : invasives, nouvelles, rares ou menacées.

 

En effet, l’ADN est le support de l’information génétique et la signature des êtres vivants. Les individus laissent des traces de leur passage dans l'environnement : des gouttelettes de salive, du mucus, de la peau, des écailles, des déjections, des cellules en décomposition… Ces restes chargés d’ADN qui flottent dans l’air, se déplacent au gré des courants fluviaux et marins et se déposent sur le sol ou dans les sédiments, sont communément appelés ADN environnemental (ADNe). Ainsi, à l’instar des inspecteurs de police scientifique inspectant l’ADN suspect des scènes de crime, les biologistes extraient l’ADN contenu dans des échantillons d’environnement afin de caractériser les espèces qui y vivent, …ou qui n'ont fait que transiter vers d'autres sites (espèces migratrices).

 

Les premières études terrestres en ADNe remontent à 2003, soit il y a seulement vingt ans. En France, la première utilisation de l’ADNe a concerné la détection d’une espèce aquatique de vertébrés, en 2007. Il s'agissait d'identifier la grenouille taureau, Lithobates catesbeianus, introduite dans le Sud-Ouest de la France en 1968. C'est aussi grâce à l'ADNe que des traces d'ADN d'animaux disparus comme le mammouth laineux (Mammuthus primigenius) et le moa géant (Dinornis robustus) ont été identifiées dans des sédiments de Sibérie et de Nouvelle-Zélande.

 

En 2016, l'initiative du Prince Souverain Albert II de Monaco de prendre le témoin que lui tendait à travers plusieurs générations Son trisaïeul le Prince Albert Ier de Monaco (1848 - 1922) et de relancer un cycle d'Explorations de Monaco alliant les forces vives de la Principauté : Sa Fondation Prince Albert II de Monaco, le Centre Scientifique de Monaco et le Yacht Club de Monaco, a permis à deux scientifiques français : David Mouillot et Tony Dejean, de se réunir autour d'un projet ambitieux.

 

"David Mouillot, professeur à l'Université de Montpellier, écologue marin, avait suivi les travaux que nous avions menés en eau douce avec l'ADN environnemental", explique Tony Dejean, fondateur de SPYGEN. "Il m'a proposé de l'accompagner dans l'aventure maritime de la première des Explorations de Monaco, à bord du YERSIN de François Fiat, sans trop savoir à l'époque où cela nous mènerait. Grâce à cette initiative et au soutien indéfectible de la Fondation Prince Albert II, nous avons pu mener des travaux incroyables, impensables et déployer ces technologies aux quatre coins du Monde. Ainsi, grâce au Prince, nous avons pu établir d'étroites collaborations avec la Colombie, territoire où nous venons d'installer un premier laboratoire d'analyse d'ADN environnemental. En France, l'apport de Pierre Boissery, qui a cru en notre démarche très innovante, nous a permis, grâce à des fonds de l'Agence de l'Eau Rhône Méditerranée Corse, de réaliser les premières campagnes d'inventaire fort prometteuses sur les rivages méditerranéens français. Cette collaboration a également permis de développer des bases de références génétiques pour les poissons. Car il ne suffit pas de recueillir des échantillons d'eau de mer et d'en extraire l'ADNe, encore faut-il faire coïncider chaque séquence ADN obtenue avec le nom d'espèces parfaitement identifiées au préalable, afin que l'information soit complète, valorisable, exploitable le cas échéant".

 

Les avantages seraient multiples pour la gestion des pêches adoptant une approche fondée sur l'ADNe : rentabilité, couverture géographique plus large, détection précoce des espèces invasives, évaluation des stocks, exploration d'environnements aquatiques auparavant inaccessibles, découverte de nouvelles espèces profondes, etc.

 

Mais David Mouillot va plus loin : "Si l'étude de la migration des espèces en raison du dérèglement climatique est facilitée par la collecte et l'étude d'échantillons d'ADNe, il faut se rappeler qu'à la différence de l'Homme et des animaux terrestres qui libèrent à leur mort le carbone stocké dans leur organisme, les poissons et les mammifères marins séquestrent le CO2 puis l'expédient dans les sédiments au fond de l'Océan, où il est stocké pour des millénaires. Notre projet "Blue Carbone" a donc vocation à mettre en œuvre des solutions écologiques pour maintenir les stocks de poissons, pour contribuer à la fertilisation de l'Océan et réhabiliter sa fonction naturelle de pompe à carbone. Dans cette démarche, l'intelligence artificielle est un outil que nous utilisons de plus en plus fréquemment et avec succès au sein du laboratoire MARBEC".

 

De son côté, Tony Dejean, établi au Bourget-du-Lac, loin de la mer mais près des rivières, fleuves et lacs, s'est longtemps interrogé au sujet de la manière d'augmenter ses bases de données et d'en faire profiter le plus large panel d'utilisateurs potentiels soucieux de la gestions des ressources naturelles, notamment en développant Vigilife - Observatoire Mondial du Vivant : "Quelle serait la meilleure solution pour recueillir l'ADNe dans un maximum de sites océaniques afin de mieux connaître les espèces présentes ? L'idée m'est venue d'armer une flotte de catamarans à voile de croisière de 15-20 mètres. Ils pourraient se déplacer à moindre coût sur l'Océan sans rejet de CO2 pour recueillir un maximum d'informations en un minimum de temps sur une multitude de sites. Reste à vérifier dans la réalité la pertinence et l'efficacité scientifiques d'un tel dispositif…".

 

"Contribuer à ce que David Mouillot et son équipe au sein de MARBEC, d'un côté, et que Tony Dejean et ses collaboratrices et collaborateurs de SPYGEN et de Vigilife, de l'autre, développent leurs procédures de collecte et d'analyse d'échantillons marins d'ADNe, entre dans le cadre de notre volonté de faire ce que j'appelle la "Science de l'Usage" en opposition à la "Science du Constat", commente Yvan Griboval, Président de OceanoScientific et Directeur des Expéditions éponymes. "Grâce à ces méthodes, il semble possible d'orienter les pêcheurs - côtiers dans un premier temps - vers des sites peu fréquentés du fait de l'habitude, parfois transmise de père en fils, de pêcher systématiquement sur les mêmes sites …en se plaignant que la ressource diminue. Et pour cause, ils ne pêchent qu'à cet endroit ! Grâce à l'utilisation des informations générées par l'étude de l'ADNe, il serait possible d'inciter les pêcheurs à changer leurs habitudes, à prospecter de nouveaux sites et, de ce fait, à permettre à la ressource de se reconstituer naturellement sur des sites de surpêche, pour que leurs actions de pêche deviennent vertueuses et durables. La Nature y gagnerait. Le pêcheur aussi. Quant au consommateur, il aurait la garantie d'un poisson de qualité dans son assiette".

 

Autre usage essentiel pour la pêche, le rôle de sentinelle des espèces invasives grâce à l'ADNe, motivé par la nécessité de détecter de manière précoce ces espèces avant qu'elles ne puissent s'établir, se propager et causer des impacts écologiques et économiques irréversibles.

 

Parlez-en aux marins pêcheurs du Sud Finistère. Ils voient en ce moment leurs objectifs de pêche à la coquille Saint-Jacques sur le gisement des Glénan, plutôt rémunératrice, ruinés par la présence de poulpes (Le Marin & Ouest-France, 23 novembre 2022). Oui une invasion de poulpes en Bretagne ! Ceux-là même que les vacanciers aiment tant déguster l'été sur les terrasses des plages de la Côte d'Azur avec un rosé de Provence bien frais. Vous avez dit dérèglement climatique ?…