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Expédition OceanoScientific
Iles Éparses 2022-2023

Mardi 28 juin 2022

Mieux appréhender le dérèglement climatique 

Dans un peu moins de cinq mois, la première campagne océanographique à la voile sans rejet de CO2 du cycle des Expéditions OceanoScientific 2022-2027 à destination des Iles Éparses (Océan Indien - France) quittera Marseille, puis Toulon, Nice ensuite et le Yacht Club de Monaco cap au Sud-Est. Le nouvel OceanoScientific Explorer, un catamaran dénommé LOVE THE OCEAN, sera équipé de l'OSC System Version 4.0 de collecte de données physico-chimiques à l'interface Air-Mer, lui-même piloté par le nouvel OSC-Software (Version 3.0), tout juste finalisé par les équipes de ROM-arrangé, le spécialiste des systèmes informatiques embarqués et des communications satellitaires sur les voiliers de course océanique : monocoques IMOCA 60 du Vendée Globe comme trimarans Ultim. C'est d'ailleurs grâce à un logiciel destiné à ces voiliers d'exception que l'idée qui a présidé à la création du Programme OceanoScientific en 2006 se concrétise seize ans plus tard. Pendant ce temps, les deux scientifiques plongeuses professionnelles de l'association OceanoScientific continuent leur apprentissage des techniques de séquençage ADN/ARN sous la tutelle du Professeur Christian Siatka de l'École de l'ADN, désormais en relation avec les équipes de l'antenne française de Thermo Fisher Scientific, leader mondial des services scientifiques.

"Autodidacte et sans aucune formation de scientifique, océanographe, météorologue ou climatologue", explique Yvan Griboval, "j'ai imaginé en 2005-2006 que si on collectait un grand nombre de données à l'interface Air-Mer à un même instant, à un même endroit et qu'on reportait l'ensemble sur un seul tableau, on devrait potentiellement observer quel paramètre évolue avec quel autre. Les scientifiques pourraient alors mieux appréhender les causes et les conséquences du dérèglement climatique, surtout si on réalise cela dans des zones maritimes essentielles pour le Climat, mais peu ou pas renseignées, comme le Grand Sud où j'ai mené l'Expédition OceanoScientific 2016-2017. Or, jusqu'ici, personne ne réussissait à mettre en œuvre ce fameux graphique aux données évoluant ensemble en temps quasi réel sur des voiliers, de surcroît de petite taille, inférieurs à vingt mètres. Aujourd'hui, grâce au travail de Louis Civilise (ROM-arrangé / École Supérieure d'Électronique de l'Ouest - Angers), ce rêve un peu fou lorsque je l'ai fait il y a plus de quinze ans devient réalité. C'est une immense satisfaction !"

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Dans les ateliers de ROM-arrangé à Lorient, Louis Civilise présente à Linn Sekund (OceanoScientific) les fonctionnalités de l'OSC-Software 3.0, dont le fameux graphique évoluant en temps quasi réel de l'ensemble des données physico-chimiques des paramètres essentiels de l'interface Air-Mer, qui sont collectées automatiquement par l'OSC System. Photo OceanoScientific 

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Mathieu Boimard (au centre), Responsable scientifique européen des matériels de séquençage au sein de Thermo Fisher Scientific France, échange avec le Professeur Christian Siatka (à droite), créateur et Directeur de l'École de l'ADN,

au sujet des performances du séquenceur haut débit Ion GeneStudio S5 XL Prime System de Ion Torrent, en présence, de gauche à droite, de : Carla Di Santo et Linn Sekund, scientifiques de l'association OceanoScientific et Guillaume

Tenca (ex-Directeur de QIMA Life Science / Directeur de BuzzUp). Photo Bouchera Douah (Thermo Fisher Scientific)

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Scientifiques et plongeuses professionnelles, Linn Sekund et Carla Di Santo (à droite) de l'association OceanoScientific, auront également à réaliser les séquençages ADN/ARN à bord du catamaran LOVE THE OCEAN. Elles se familiarisent ici avec le KingFisher Duo Prime de Thermo Fisher Scientific, grâce aux explications de Emmanuel Guillard, Responsable scientifique des produits KingFisher (dissimulé derrière Linn Sekund). Ce matériel sert à la préparation des échantillons. Il offre une extraction et une purification constantes de l'ADN/ARN, des protéines et des cellules. Photo Bouchera Douah (Thermo Fisher Scientific)

Lundi 16 mai 2022

Histoires de requins tigres et requins bouledogues à Marseille 

Plus la date de départ de la première des cinq campagnes des Expéditions OceanoScientific 2022-2027 à destination des Iles Éparses (Océan Indien - France) se rapproche - ce sera durant la seconde quinzaine du prochain mois d'octobre consécutivement à Marseille, Toulon, Nice et Monaco - plus chaque paramètre est étudié dans le détail. L'éloignement des Iles Éparses de tout port et leur positionnement sur la route des cyclones et des puissantes dépressions tropicales de l'Océan Indien sont des conditions qui compliqueront ces campagnes océanographiques à la voile sans rejet de CO2. Le respect des habitants des récifs coralliens qui seront bioprospectés par Carla Di Santo et Linn Sekund sera primordial. En effet, ces iles inhabitées et interdites d'accès sont réputées pour leur extraordinaire biodiversité. C'est donc probablement un des endroits au Monde où la concentration de grands requins est la plus forte. Tigres, bouledogues et autres espèces sont légions ! Pour cela, l'équipe des Expéditions OceanoScientific vient de se renforcer. Steven Surina, un des plus célèbres plongeurs professionnels spécialisés dans l'étude du comportement des grands squales rejoint l'équipage du catamaran LOVE THE OCEAN, avec la double tâche d'encadrement sécurité des deux plongeuses par le "dialogue" avec les squales et la réalisation de reportages vidéo de leurs plongées …lorsque requins tigres, bouledogues et autres espèces l'autoriseront. Steven, devenu maître en interprétation du langage corporel de ces animaux extraordinaires, effectue près de trois cents plongées par an avec des touristes pour les mettre en contact avec ces requins en toute sécurité, dans le cadre de ses missions de Shark Education. Prochaines stagiaires avant les plongées aux Iles Éparses : Carla et Linn…

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Steven Surina au contact de requins tigres aux Bahamas. Gros animaux curieux, ces squales réputés terribles prédateurs peuvent être de paisibles compagnons de jeux à qui sait se comporter avec bienveillance avec eux,

une fois leur langage corporel assimilé et interprété. Photo Joe Mazzi

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Les plongeuses professionnelles scientifiques Carla Di Santo (à gauche) et Linn Sekund (OceanoScientific) entourent

Steven Surina au terme de la première réunion de préparation des plongées aux Iles Éparses. Steven cumulera

le rôle de "Plongeur Sécurité" et, parfois, de Chef opérateur de prises de vues sous-marines. Photo OceanoScientific

Lundi 14 mars 2022

 Préparation des équipements et procédures scientifiques 

L’équipe scientifique de l'association OceanoScientific s'élargit et progresse dans la préparation des Expéditions OceanoScientific 2022-2027. D'un côté, la définition des procédures relatives aux séquençages ADN et ARN d'échantillons d'organismes marins. Ils seront réalisés à bord du nouvel OceanoScientific Explorer dénommé LOVE THE OCEAN durant l'hiver prochain (été austral). De l'autre, les équipements constitutifs de la Version 3.0 de l'OSC System. La collaboration technique avec l'antenne de l'Institut de Recherche pour le Développement (IRD) de Plouzané (Brest - France) se prolonge ainsi sous les directives de l'ingénieur Denis Diverrès, dont les conseils avisés permirent le succès de l'Expédition OceanoScientific 2016-2017 sous le 40e Sud. Quant à la grande innovation qui va consister à réaliser le séquençage génétique d'organismes marins des récifs coralliens des îles françaises de l'Océan Indien sur un voilier, un partenariat est mis en œuvre avec l'École de l'ADN dirigée par le Professeur Christian Siatka à Nîmes (France). 

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Les 22 et 23 février 2022, dans les locaux de l'École de l'ADN à Nîmes, Linn Sekund, à gauche et Carla Di Santo encadrent le Professeur Christian Siatka qui leur apprend les gestes essentiels des procédures de séquençage qu'elles auront à mettre en œuvre à bord du catamaran LOVE THE OCEAN. Photo OceanoScientific

Après Linn Sekund, Suédoise dotée d'un master de conservation de la biodiversité marine obtenu au Portugal après une licence en management environnemental en Grande-Bretagne, qui a rejoint les Expéditions OceanoScientific dans le courant de l'année 2020 au poste de Coordinatrice Scientifique, c'est au tour de Carla Di Santo d'intégrer l'association OceanoScientific en ce début d'année 2022. Antérieurement technicienne de laboratoire en microbiologie médicale, responsable de programmes de conservation marine aux Maldives ou plongeuse professionnelle à Marseille, Carla Di Santo est titulaire d'un master en bio-ressources aquatiques complété d'un diplôme de chef de projets en aquaculture durable et halieutique de l'Université de Montpellier. Dans l'équipe OceanoScientific, Carla Di Santo est à la fois Coordinatrice Scientifique et Responsable de Plongée.

 

De son côté, l'an dernier, Linn Sekund a complété ses compétences scientifiques et environnementales par une formation professionnelle de plongée. Toutes deux travailleront en effet en tandem pour recueillir les échantillons d'organismes marins sur les récifs coralliens, puis pour en réaliser le séquençage dès leur retour à bord du catamaran LOVE THE OCEAN.

 

Cette bioprospection ciblera quatre familles distinctes d'organismes marins : anthozoaires (corail, anémones, méduses) ; ascidies (invertébrés) ; spongiaires (éponges) ; végétaux (algues). L'objectif est autant la recherche d'organismes marins inconnus ou méconnus génétiquement, que la préservation du patrimoine génétique du domaine sous-marin français, le plus étendu au Monde.

 

Les séquences génétiques qui résulteront de ces bioprospections seront précieusement stockées dans un cloud afin d'être accessibles prioritairement aux étudiants français, aux instituts scientifiques, mais également aux industriels de la Santé et du Bien-être. De cette manière, il sera possible d'exploiter économiquement et vertueusement ces fantastiques ressources naturelles françaises par biomimétisme. C'est une manière concrète de préserver la vie sur les récifs en évitant le pillage. C'est aussi l'occasion de préserver le patrimoine génétique d'organismes qui vivent sur la Planète depuis plusieurs centaines de millions d'années (cnidaires / anthozoaires) et qui sont aujourd'hui menacés de disparaitre du fait de l'augmentation de la température et de l'acidité de l'eau de mer, conséquences directes de l'activité humaine (anthropisme).

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En utilisant la technologie de l'OSC System Version 2.1 qui a fonctionné avec succès autour du monde durant l'été austral 2016-2017, Denis Diverrès et Linn Sekund conçoivent actuellement la Version 3.0, comme ici le 10 février 2022 dans l'atelier de l'antenne IRD IMAGO du Campus Ifremer de Plouzané (Brest - France). Photo OceanoScientific

Dans le laboratoire de l'École de l'ADN, Linn Sekund, à gauche et Carla Di Santo se familiarisent avec le matériel qu'elles utiliseront à bord du catamaran LOVE THE OCEAN lorsqu'elles seront sur les récifs coralliens français des îles de l'Océan Indien, au tout début de l'année 2023. Photo École de l'ADN

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